Повествование происходит во вселенной, близкой к нашей, в начале 20 века, где исследователи смогли использовать как науку, так и магию. Благодаря сочетанию этих сил стало возможным придавать безжизненным предметам черты, напоминающие жизнь. Эти творения называются «механическими куклами». История вращается вокруг Акабанэ Райшина, выходца из давней японской семьи Онмёдзи, осиротевшего из-за убийства. К счастью, в его жизни появляется Сёко Карюсай и спасает его от опасности. Из благодарности Акабанэ клянется ей в верности. Заметив горе мальчика, Сёко решает помочь ему найти преступника и отомстить ему - правда, сначала он должен подготовиться с помощью своего самого совершенного творения: Яя - робота-киборга, почти неотличимого от человека. После этого они поступают на службу в Королевскую академию машинных искусств, где, как предполагается, может жить убийца семьи Рейшин. После этого они начинают свою миссию по восстановлению справедливости и возмездия против преступного злодея.