В середине девятнадцатого века Япония находилась в состоянии волнения и беспорядков после многовекового уединения. Это породило новые мысли, некоторые из которых могли быть очень опасными. Именно в это время Кодо Юкимура, известный целитель, обучавшийся у голландских мастеров, принял приглашение в столицу и внезапно пропал. Его дочь Чизуру не выдержала напряжения и, облачившись в самурайское одеяние, взяла меч своего отца Кодачи и отправилась в Киото на его поиски. В первую же ночь своего пребывания там она стала свидетельницей битвы между двумя группами самураев, после чего победители захватили пленницу. Для Кидзуру стало шоком, что это были не кто иные, как Синсэнгуми - организация, которой боялись как друзья, так и враги, и с которой ее отец был связан для какой-то великой цели. Далее Чидзуру и ее товарищи отправляются в эпическое путешествие, пытаясь разгадать этот загадочный феномен!