В этом мире есть те, кто владеет искусством алхимии - способностью изменять материю и создавать из нее нечто новое. Однако все алхимики связаны первым законом алхимии: нельзя создать что-то, не пожертвовав чем-то равноценным. Единственный способ обойти этот закон - использовать легендарный философский камень, хотя метод его создания был утерян со временем.
Главные герои, Эдвард и Альфонс Элрики, усвоили этот урок еще в детстве. Они пытались с помощью алхимии вернуть свою мать из мертвых и заплатили за это страшную цену: Альфонс потерял тело, а Эдвард - руку и ногу. Хотя Эдвард смог спасти дух Альфонса, запечатав его в древнем доспехе, они оба отправляются в путешествие, чтобы найти философский камень и вернуть то, что было потеряно много лет назад.