В другой вселенной, очень похожей на современную Японию, живут существа под названием эсперамы, обладающие необычными способностями. Молодой человек по имени Том Камидзё живет в городе-академии, где почти все жители - студенты, получающие необходимые знания. Отличие Тома в том, что его правая рука способна рассеивать магические и психические воздействия, нейтрализуя их силу. Однажды скептически настроенный Том обнаруживает на своем балконе симпатичную девушку в монашеском одеянии.
Очаровательная незнакомка представляется Индекс и рассказывает ему невероятную историю о своей памяти, в которой хранится более ста тысяч запретных магических книг. По словам девушки, она сбежала из туманного Альбиона, и теперь ее преследуют хорошо обученные волшебники, чтобы она никому не раскрыла содержание манускриптов.